Negli anni novanta, Mike tiene compagnia agli italiani sia di giorno sia in prima serata. In prime time, solo per citare i programmi più rilevanti, conduce i quiz TeleMike (fino al 1992) e Tutti x uno (1992-1993), le gare canore C’era una volta il Festival (1989-1990), Festival Italiano (1993-1994) e Viva Napoli (1994-2002), e con Bravo Bravissimo (1991-2002) valorizza giovanissimi talenti. Dal 30 settembre 1991, La ruota della fortuna diventa un appuntamento quotidiano del preserale di Canale 5: farà da “traino” al TG5, in onda dal 13 gennaio 1992. È Mike a volere che il TG vada in concorrenza con il TG1 delle ore 20. Successivamente, Mike viene chiamato a potenziare Rete 4 dove, dal 1996, porta La ruota della fortuna a mezzogiorno, e Bravo Bravissimo e Viva Napoli in prima serata. Conduce quindi TeleMania, un quiz per esperti di storia della televisione, e fonda la Bongiorno Productions con la moglie Daniela. Dalla Rai, intanto, giunge un invito inatteso: la conduzione, a diciotto anni dall’ultima, del Festival di Sanremo (1997). Nel 1998, Mike entra nel Guinness dei primati come “presentatore attivo” più longevo al mondo. Nel 1999, per Canale 5, dopo il talent canoro Momenti di gloria, conduce Allegria!, quiz che lo vede anche come “materia” cui dovrà rispondere Gerry Scotti, concorrente con Amadeus e Simona Ventura. Il 29 settembre del 2000 conduce con Paolo Bonolis Ricomincio da 20, serata celebrativa per i vent’anni di Canale 5. E nell’estate 2001 presenta Paperissima Sprint, di Antonio Ricci. Mike porta avanti La ruota della fortuna fino al 20 dicembre 2003, toccando quota 3.125 puntate, mentre è già al timone del quiz per ragazzi Genius. Il 3 gennaio 2004, è ospite d’onore di Pippo Baudo su Rai Uno in Buon compleanno TV, per celebrare il mezzo secolo della TV italiana, e, per i suoi ottant’anni, il presidente Carlo Azeglio Ciampi lo nomina “Grand’Ufficiale, con Ordine al merito della Repubblica italiana”. In seguito, instaura un ironico rapporto di complicità con Rosario Fiorello, prima negli spot di una compagnia telefonica e poi in Viva Radio 2. Nel 2005 Mike conduce su Rai Uno la cerimonia di premiazione del David di Donatello. Nel 2006, su Rete 4, Mike conduce il suo ultimo quiz: Il migliore. Nel 2007 presenta su Rai Uno Miss Italia, firma con il figlio Nicolò la sua autobiografia La versione di Mike e, il 13 dicembre, viene insignito della laurea magistrale honoris causa in Televisione, Cinema e Produzione multimediale dall’Università IULM di Milano. Nel maggio 2009, Mike prende accordi con Sky Italia per RiskyTutto.